EcoAmp

在苹果系统电脑中安装最新版本EcoAmp

在苹果系统电脑中安装最新版本EcoAmp

前言 本篇推文的内容介绍一下在苹果电脑系统MacOS中如何安装使用EcoAmp 1、下载一键安装命令脚本 小飞机网盘:https://share.feijipan.com/s/OcWZKenG 科技网盘:https://pan.cstcloud.cn/s/P5gVdTvtR4o 百

2026-01-18
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随机森林分析+绘图教程

随机森林分析+绘图教程

0前言 随机森林一般在模型中用于分类和回归任务,但是对于小数据或者不需要独立验证集的数据来说可以使用整个数据集来构建随机森林模型,并从中计算特征重要性、决定系数以及间接评估P值。主要用到三个包,randomforest、rfPermute和A3,其中A3是用于评估模型整体的P值的。 本期绘制

2025-10-25
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EcoAmp中数据标准化方法介绍

EcoAmp中数据标准化方法介绍

EcoAmp软件中使用的标准化函数是 vegan 包中的 decostand 函数,下面是各个标准化方法的介绍: 1. total  👉 按行(样本)或列(物种)的总和进行标准化。 公式:每个值 ÷ 该行(或列)的总和。 常用于将样本数据转化为相对丰度(百

2025-09-21
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一文学会!12种带统计检验的柱状图绘制,宝藏工具EcoAmp速上手

一文学会!12种带统计检验的柱状图绘制,宝藏工具EcoAmp速上手

0前言 📢 新工具重磅分享:告别繁琐绘图与统计!用 EcoAmp 轻松产出出版级柱状图!📊 还在为数据的统计绘图而头疼吗?EcoAmp——一款专为生态学者打造的扩增子分析软件(A software for Ecologists to analyse Amplicon data.),能让这一切

2025-09-10
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🌿【用EcoAmp一键绘制RDA图】环境驱动分析从未如此简单!

🌿【用EcoAmp一键绘制RDA图】环境驱动分析从未如此简单!

1 前言 🔍 RDA能做什么? 冗余分析(RDA)帮你找到影响物种分布的关键环境因子!比如温度、pH如何塑造微生物群落 🌡️→🦠 2 本期结果图展示 3 数据准备 绘制RDA图需要三个数据文件,分别是OTU物种数据、分组数据和环境因子数据,展示具体格式如下: 本期使用的是EcoA

2025-06-06
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基于plspm包的偏最小二乘结构方程模型

基于plspm包的偏最小二乘结构方程模型

前言 偏最小二乘结构方程模型(PLS-SEM)是一种多变量分析方法,结合了 路径分析 和 潜变量建模 的优势,特别适用于小样本、预测导向或理论开发的研究场景。plspm 包是 R 中实现 PLS-SEM 的强大工具,助你轻松建模复杂因果关系! 🔍 PLS-SEM 的核心特点 1️⃣ 预测为

2025-05-28
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跟着Nature学绘图-堆叠柱状图

跟着Nature学绘图-堆叠柱状图

前言 堆叠柱状图 是一种用于展示 分类数据组成比例 的统计图表,通过将不同类别的数据 “堆叠” 在同一个柱子上,直观呈现 整体与部分的关系,适用于比较多个组别的构成差异。 📌 堆叠柱状图的核心特点 展示构成比例 每个柱子代表一个 整体(如样本、时间点、实验组),柱

2025-05-21
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跟着Nature学绘图-小提琴图

跟着Nature学绘图-小提琴图

前言 小提琴图 是一种结合 箱线图(Box Plot) 和 核密度估计(Kernel Density Estimation, KDE) 的数据可视化工具,能够直观展示数据的 分布形态、密度、中位数、四分位数 等信息。 📌 小提琴图的核心特点 数据分布可视化 宽度代

2025-05-21
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跟着Nature学绘图-NMDS

跟着Nature学绘图-NMDS

【📢 生态学者福音!EcoAmp 一键绘制 NMDS 图 🌿】 还在为 β多样性分析 的复杂代码烦恼?用 EcoAmp 轻松搞定!专为生态学者设计的 扩增子分析神器,零代码实现专业级可视化! ✨ NMDS(非度量多维标度)功能亮点: ✅ 一键生成 高颜值 NMDS 图,直观展示样本群落差异

2025-05-15
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主成分分析(PCA)图形绘制

主成分分析(PCA)图形绘制

【📢 生态学者必备!EcoAmp 一键绘制 PCA 图 📊】 还在为 扩增子数据分析 写 R 脚本头疼?试试 EcoAmp!一款专为生态学者设计的 扩增子分析软件,集成 50+ 实用功能,零代码 搞定下游分析! ✨ PCA(主成分分析)功能亮点: ✅ 一键生成 高质量 PCA 图,轻松可视化样

2025-05-14
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