跟着Nature学绘图-小提琴图
前言
小提琴图 是一种结合 箱线图(Box Plot) 和 核密度估计(Kernel Density Estimation, KDE) 的数据可视化工具,能够直观展示数据的 分布形态、密度、中位数、四分位数 等信息。
📌 小提琴图的核心特点
-
数据分布可视化
-
宽度代表数据密度,越宽的地方表示数据点越集中。
-
可以直观看出数据是 单峰、双峰 还是 偏态分布。
-
-
统计信息整合
-
通常内置 箱线图(显示中位数、四分位数、异常值)。
-
比传统箱线图更直观,避免因“数据平滑”而丢失细节。
-
-
多组数据对比
-
适合展示 不同组别(如实验组 vs 对照组) 的数据分布差异。
-
本期教程绘制小提琴图展示
今天来复现一篇Nature Communications中的一副小提琴+箱线图,文章信息如下:
DOI:10.1038/s41467-022-31113-w
数据准备
1.数据文件,excel表格,第一列为样本的id,第二类为绘图数据
2.分组数据
第一列为样本id,第二列是分组信息
EcoAmp复现
打开小提琴绘图功能模块
拖入准备好的数据文件和分组文件到对应的位置
默认绘图进去之后是下面的样子的
然后导入准备好的配置文件(原始数据和配置文件我会放在文末)
然后点击刷新,即可一键复现本篇论文的小提琴图
数据下载
本期数据和配置文件下载链接:
分享文件:006小提琴图[文件夹]
云盘链接:https://pan.cstcloud.cn/s/HF3PkHiS9Y 过期时间:2038-03-27 09:58:07
EcoAmp软件下载
下面文字可以查看下载和安装教程:
本文最后更新于
2025-05-21
如有失效,请留言
THE END