置顶EcoAmp最新版本安装
1、下载最新版本EcoAmp 首先解释一下EcoAmp的绘图实现,是使用python提供GUI界面处理传入参数然后使用封装好的R语言脚本进行绘图和数据处理,使用python 3.11.5版本开发,R语言使用的版本是R-4.5.0,不同版本的R也是可以兼容的(但是由于某些R包没安装报错,在本地安装一
阿里云学生代金券抵扣百炼 API
一 这项权益是什么 完成阿里云大学生认证后,部分用户可以领取 300 元/年的学生代金券或抵扣金。这笔额度通常用于云产品消费,原文实测还可以抵扣阿里云百炼大模型 API 的调用费用。 配合 CC Switch 等 API 路由工具,可以在 Claude Code 等客户端中切
在苹果系统电脑中安装最新版本EcoAmp
前言 本篇推文的内容介绍一下在苹果电脑系统MacOS中如何安装使用EcoAmp 1、下载一键安装命令脚本 小飞机网盘:https://share.feijipan.com/s/OcWZKenG 科技网盘:https://pan.cstcloud.cn/s/P5gVdTvtR4o 百
R-4.4.1及R-studio保姆级安装配置详细教程及常见问题解答
前言 我不生产知识,我只是知识的搬运工,以下内容是源于 CSDN - 数模加油站 的安装教程:最新R(4.4.1)及R-studio保姆级安装配置详细教程及常见问题解答 个人是觉得 R 的安装是比较麻烦的,所以我将他讲的安装教程稍作修饰写成文档的形式,方便今后我或者其他人查阅 大家是不
批量重命名文件名称(windows端)
前言 最近在整理微生物测序数据的时候需要重命名一下文件,但是一个文件夹中样本有太多了,因此在网上找到了一个批量重命名的方法,特此记录一下,防止以后需要用到的时候忘记。 开始教程 现在是需要将我下面的文件夹中的样品编号进行对应的重命名 第一步,首先复制所有的文件名称,全选之后右击鼠
随机森林分析+绘图教程
0前言 随机森林一般在模型中用于分类和回归任务,但是对于小数据或者不需要独立验证集的数据来说可以使用整个数据集来构建随机森林模型,并从中计算特征重要性、决定系数以及间接评估P值。主要用到三个包,randomforest、rfPermute和A3,其中A3是用于评估模型整体的P值的。 本期绘制
EcoAmp中数据标准化方法介绍
EcoAmp软件中使用的标准化函数是 vegan 包中的 decostand 函数,下面是各个标准化方法的介绍: 1. total 👉 按行(样本)或列(物种)的总和进行标准化。 公式:每个值 ÷ 该行(或列)的总和。 常用于将样本数据转化为相对丰度(百
一文学会!12种带统计检验的柱状图绘制,宝藏工具EcoAmp速上手
0前言 📢 新工具重磅分享:告别繁琐绘图与统计!用 EcoAmp 轻松产出出版级柱状图!📊 还在为数据的统计绘图而头疼吗?EcoAmp——一款专为生态学者打造的扩增子分析软件(A software for Ecologists to analyse Amplicon data.),能让这一切
KEGG所有ko及对应通路整理
下载json文件 点击 这里 进入下载页面,右键从链接另存文件 获得的json文件如图: 使用python处理json文件 JSON (JavaScript Object Notation) 是一种轻量级的数据交换格式,在python中可使用json包进行解码与编码,主要
MetaPhlAn 4—宏基因组物种注释工具
今天为大家带来一款非常新的,但是功能非常强大的生信分析工具– MetaPhlAn 4.2.2。 MetaPhlAn是一种计算工具,用于从元基因组霰弹枪测序数据(即非16S)也就是宏基因组数据中分析物种级微生物群落(细菌、古细菌和真核生物)的组成。最新版的MetaPhlAn 4发表在20