前言 📊【数据检验不可少!EcoAmp 正态性 & 方差齐性检验指南】 ❓ 为什么要做这些检验? 生态统计模型(如ANOVA、回归、PERMANOVA)大多基于 正态分布 和 方差齐性 假设,若数据不符合条件,可能导致: ✖ 假阳性/假阴性(p值失真) ✖ 模型偏差(参数估计不准确
前言 🚀【用EcoAmp提取主成分,简化复杂生态数据!】 🔍 为什么要提取主成分? 生态数据(如土壤理化性质、微生物群落)往往变量多、共线性强,直接分析易导致模型过拟合或结果难以解释!主成分分析(PCA/PAC) 能: ✅ 降维:用少数主成分代替多个相关变量(如用PC1概括pH、有机碳等土壤
前言 🔬【微生物组数据分析小课堂】📊 什么是OTU/ASV稀释曲线(Rarefaction Curve)? ✨ 作用:评估测序深度是否足够反映样本真实多样性! 📈 怎么看:曲线平缓=测序充分;上升中=需更多数据 💡 关键点: 1️⃣ 比较不同样本时建议统一抽样深度 2️⃣ ASV(精确
今天要复现的图来自2024年 2月的一篇Nature Communication。今天先来复现其中的一幅柱状图。 前言 今天这副图片的内容是批量柱状图+散点+差异分析,我们使用EcoAmp来进行绘制。使用我下面设置好的模板即可一键复现 原文图片+我的复现 数据准备 从原
今天要复现的图来自2021年 7月的一篇Nature Communication。今天先来复现其中的一幅箱线图。 前言 今天这副图片的内容是批量箱线图+散点+差异分析,我们使用EcoAmp来进行绘制。EcoAmp是一个使用R语言作为绘图工具,python编写界
在EcoAmp中使用大模型的效果 1、找到EcoAmp配置AI大语言模型的位置 2、配置Deepseek 首先去Deepseek开放平台官网获取api密钥 https://platform.deepseek.com/usage 然后复制创建好的API
作图结果: 1、结构方程模型 结构方程模型(Structural Equation Modeling, SEM)是一种多变量统计分析方法,用于分析变量之间的复杂关系,尤其适用于涉及潜变量(无法直接测量的变量,如“满意度”“智力”等)的研究。它结合了因子分析(测量模型)和路径分析(结构模型),
1、绘图效果: 2、数据准备 数据文件: 分组文件: 3、使用EcoAmp绘图教程 拖入准备好的文件: 等待几秒出现绘图面板,然后导入配置文件 导入配置文件之后刷新图片,即可一键复刻本教程的模板,文末提供示例数据和下载链接
1、绘图效果: 2、数据准备 数据文件: 分组文件: 3、绘图教程 选择柱状图分面二号这个功能: 然后拖入相应的文件点击开始运行 会出现下面的界面 这个绘出图的模板是默认的,可以进行手动调整,也可以直接导入之前保存的配置文件(配
α多样性(Alpha Diversity)即生境内的多样性(within-habitat diversity),是指某一栖息地或微生物群落在物种水平上数目和频率的分布特征,包含物种的丰富度和均匀度。 使用EcoAmp一键计算物种的α多样性: 先看一下计算的结果: 计算方法: 数据