PCA/NMDS主成分一键提取

前言

🚀【用EcoAmp提取主成分，简化复杂生态数据！】

🔍 为什么要提取主成分？
生态数据（如土壤理化性质、微生物群落）往往变量多、共线性强，直接分析易导致模型过拟合或结果难以解释！主成分分析（PCA/PAC） 能：
✅ 降维：用少数主成分代替多个相关变量（如用PC1概括pH、有机碳等土壤因子）
✅ 去噪：保留关键信息，减少冗余变量的干扰
✅ 兼容SEM：在结构方程模型中，主成分可作为潜变量（如“土壤肥力”=PC1+PC2），解决观测变量过多的问题

📢 本期推文将手把手教你用👉 #EcoAmp 软件，快速提取主成分并应用于生态分析！

数据准备

第一列是样本的ID，后面的列代表不同的指标，将对所有的指标进行主成分第一轴的提取，具体方法见下文

EcoAmp一键提取

打开 PCA-NMDS提取主成分 这个功能

选择提取主成分的方法，然后将数据粘贴进去，接着点击运行程序即可

运行成功的结果如下：

数据下载

使用的数据为EcoAmp内置的数据，点击打开示例数据即可查看