🌿【用EcoAmp一键绘制RDA图】环境驱动分析从未如此简单!
1 前言
🔍 RDA能做什么?
冗余分析(RDA)帮你找到影响物种分布的关键环境因子!比如温度、pH如何塑造微生物群落 🌡️→🦠
2 本期结果图展示
3 数据准备
绘制RDA图需要三个数据文件,分别是OTU物种数据、分组数据和环境因子数据,展示具体格式如下:
本期使用的是EcoAmp软件内置的数据
3.1 物种数据(第一列为OTU的编号,后面的列为样本id,每个样本一列):
3.2 分组数据
3.3 环境数据
4 开始绘图
打开EcoAmp找到RDA功能
然后依次拖入准备好的数据文件:
点击运行即可出现结果
接着调整右边的参数进行美化即可。
5 数据文件下载
https://pan.cstcloud.cn/s/TozhBLeTRyM
6 EcoAmp软件下载
软件完全免费,不收任何费用,开发的历程和初衷:https://www.leoduo.cn/ecoamp_intro
软件下载和安装教程:https://www.leoduo.cn/ecoamp_install.html
本文最后更新于
2025-06-6
如有失效,请留言
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