跟着Nature学绘图-小提琴图

前言

小提琴图 是一种结合 箱线图(Box Plot) 和 核密度估计(Kernel Density Estimation, KDE) 的数据可视化工具,能够直观展示数据的 分布形态、密度、中位数、四分位数 等信息。

📌 小提琴图的核心特点

  1. 数据分布可视化

    • 宽度代表数据密度,越宽的地方表示数据点越集中。

    • 可以直观看出数据是 单峰、双峰 还是 偏态分布

  2. 统计信息整合

    • 通常内置 箱线图(显示中位数、四分位数、异常值)。

    • 比传统箱线图更直观,避免因“数据平滑”而丢失细节。

  3. 多组数据对比

    • 适合展示 不同组别(如实验组 vs 对照组) 的数据分布差异。

本期教程绘制小提琴图展示

今天来复现一篇Nature Communications中的一副小提琴+箱线图,文章信息如下:

DOI:10.1038/s41467-022-31113-w

数据准备

1.数据文件,excel表格,第一列为样本的id,第二类为绘图数据

2.分组数据

第一列为样本id,第二列是分组信息

EcoAmp复现

打开小提琴绘图功能模块

拖入准备好的数据文件和分组文件到对应的位置

默认绘图进去之后是下面的样子的

然后导入准备好的配置文件(原始数据和配置文件我会放在文末)

然后点击刷新,即可一键复现本篇论文的小提琴图

数据下载

本期数据和配置文件下载链接:

分享文件:006小提琴图[文件夹]
云盘链接:https://pan.cstcloud.cn/s/HF3PkHiS9Y 过期时间:2038-03-27 09:58:07

EcoAmp软件下载

下面文字可以查看下载和安装教程:

EcoAmp最新版本安装 - leo朵

 

本文最后更新于2025-05-21如有失效,请留言
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