主成分分析(PCA)图形绘制
【📢 生态学者必备!EcoAmp 一键绘制 PCA 图 📊】
还在为 扩增子数据分析 写 R 脚本头疼?试试 EcoAmp!一款专为生态学者设计的 扩增子分析软件,集成 50+ 实用功能,零代码 搞定下游分析!
✨ PCA(主成分分析)功能亮点:
✅ 一键生成 高质量 PCA 图,轻松可视化样本差异
✅ 支持 自定义 颜色、形状、标签,满足期刊级绘图需求
✅ 离线运行,数据安全有保障,告别在线工具隐私风险
✅ 参数灵活调整,适应不同分析需求
🔍 为什么选择 EcoAmp?
▪ 专为生态学者打造,无需编程基础
▪ 集成主流分析(α/β多样性、随机森林、Mantel检验等)
▪ 完全免费,无会员限制,比在线工具更自由
本期教程绘制PCA图
效果展示:
今天,我们将通过复现Nature Communications中的一副PCA图
DOI:10.1038/s41467-023-41817-2
数据准备:
论文官网下载原始数据,找到 Source Data
然后找到图5a中的数据,复制一下
整理一下数据
分组数据
EcoAmp复现
打开PCA功能模块
将准备好的数据输入到PCA绘制的输入框中,示例如下:
进去之后默认的界面是如下:
下面可以调整右边的参数对图形进行美化,我这里提前调好了本期的一个模板可以直接导入使用(后面提供配置文件可以直接使用)
导入之后,点击刷新图片即可一键复现本期图片,也可进行自定义调整其他的参数
数据下载
分享文件:03PCA[文件夹]
云盘链接:https://pan.cstcloud.cn/s/GoQMiQUPQWA 过期时间:2035-05-09 10:50:29
本文最后更新于
2025-05-14
如有失效,请留言
THE END